Kimihiro Watanuki es un estudiante de secundaria atormentado por los espíritus ayakashi, que son invisibles para todo el mundo excepto para él. La serie comienza cuando Watanuki tropieza, aparentemente por casualidad, con una tienda que concede deseos. La tienda es propiedad de Yūko Ichihara, una misteriosa bruja de muchos nombres y renombre esotérico. A cambio de un precio, se ofrece a conceder el deseo de Watanuki de librarse de los espíritus. El precio, según Yūko, debe ser de igual valor; así que, como pago, debe convertirse en el cocinero y ama de llaves temporal y a tiempo parcial de Yūko.